大和から肥前へ：松倉氏の台頭と島原入封

松倉氏はもともと大和国（現在の奈良県）を本拠地とする国人領主であった。戦国期には大和の有力大名である筒井氏に仕え、織田信長や豊臣秀吉の勢力伸長に伴って織豊大名としての地位を固めていった。関ヶ原の戦いにおいて徳川方に臣従したことで、初代の松倉重政は大和五条藩（二見城）に領地を与えられ、そこでの城下町整備や商業活性化の手腕を認められた。

1616年（元和2年）、キリシタン大名であった有馬直純が転封となった後を受け、重政は肥前国日野江（のちの島原）に4万石で入封する。重政は自らの権力を誇示するため、分不相応な規模を誇る島原城の新築や、江戸城普請といった幕府の公役を積極的に引き受けることで、将軍家への忠誠を過度にアピールしようとした。

過酷な検地とキリシタン弾圧

身の丈に合わない大事業の数々は、実質4万石に過ぎない島原藩の財政を圧迫した。これに対処するため、重政は領内で過酷な検地を実施し、実質的な石高を10万石近くに見積もることで、領民に対して極限に近い重税を課した。この時期、度重なる凶作や飢饉が重なったにもかかわらず、容赦のない年貢の取り立てが行われた。

さらに、島原地方に根強く残っていたキリスト教信仰に対しても、弾圧の手を強めた。江戸幕府の禁教政策が本格化すると、重政は雲仙地獄の熱湯を用いるなど極めて残虐な方法でキリシタンを拷問し、改宗を迫った。重政の死後、跡を継いだ息子の松倉勝家は父以上の暴政を敷き、年貢を納められない農民に対し、蓑（みの）を着せて火を放つ「蓑踊り」といった残虐極まりない私刑を課して多くの領民を死に至らしめた。

島原の乱の誘発と一族の悲惨な末路

松倉氏の限界を超えた苛政と飢饉、そして信仰への弾圧は領民の怒りを頂点に達させ、1637年（寛永14年）、天草四郎を首領とする島原の乱の勃発を招いた。この一揆は、隣領の唐津藩領であった天草地方の一揆勢とも合流し、島原半島南部の原城跡に立てこもる大規模な蜂起へと発展した。

幕府は九州諸藩の大軍を動員し、約4ヶ月に及ぶ包囲戦の末に一揆を鎮圧したが、この大乱は幕藩体制を大きく揺るがす事態となった。乱の終息後、幕府は乱の原因が松倉氏の異常な暴政にあると断定。藩主・松倉勝家は改易（領地没収）処分となっただけでなく、江戸に護送された後に斬首に処された。江戸時代を通じて、大名が切腹ではなく犯罪者扱いである「斬首」にされた例は極めて稀であり、松倉氏の悪政がいかに幕府の秩序を乱した重罪とみなされたかを物語っている。これにより、大名としての松倉氏はわずか二代で滅亡することとなった。