サン＝フェリペ号の漂着と「先兵発言」の波紋

1596年10月、フィリピンのマニラからメキシコ（新スペイン）のアカプルコへ向かっていたスペインの武装商船サン＝フェリペ号が、台風によって被災し、土佐国浦戸（現・高知県高知市）に漂着した。土佐の領主であった長宗我部元親は船を救助し、大坂の豊臣秀吉に事態を報告した。秀吉は、五奉行の一人である増田長盛を現地に派遣し、船荷を没収しようとした。これに対し、船を没収されることを恐れたスペイン側の航海士（一説には水先案内人）が、自国の強大さを誇示して威嚇しようと試みた。

その際、航海士は世界地図を示しながら「スペイン帝国が領土を拡張できたのは、まず宣教師を現地に送り込んで信者を増やし、その後に軍隊を派遣して現地の信者と協力させて征服するからだ」という趣旨の発言（いわゆる宣教師先兵論）をしたとされる。この発言が増田長盛を通じて秀吉に報告されたことで、秀吉はキリスト教の布教活動を単なる宗教活動ではなく、スペインによる日本侵略の地ならしであると強く警戒するようになった。

豊臣政権のキリスト教弾圧と「二十六聖人の殉教」

豊臣秀吉は1587年にすでに伴天連追放令を発令していたが、南蛮貿易の利益を優先したため、実質的な布教活動は黙認されている状態であった。しかし、サン＝フェリペ号事件における発言は秀吉の不信感を決定的なものにし、対キリスト教政策は強硬路線へと一変することとなった。

秀吉はただちに京都や大坂にいたフランシスコ会の宣教師や日本人信徒らを捕縛させた。彼らは長崎へと送られ、1597年2月、長崎の西坂において宣教師6名と日本人信徒20名の計26名が処刑された。これが日本史上初の公的なキリスト教徒死刑となった日本二十六聖人の殉教である。この事件は、それまでのポルトガル主導のイエズス会（穏健な布教方針）と、スペイン背景のフランシスコ会（積極的な街頭布教方針）との宗派対立も複雑に絡んでおり、豊臣政権の外交・安全保障政策においてキリスト教が最大の懸念事項として浮上する契機となった。この強硬姿勢は、後の江戸幕府による本格的な禁教・鎖国政策へと引き継がれていくこととなる。